MT 3.x のAtomフィードに不具合があるらしい・・・
Six Apartのブログによると「Movable Type 3.0以降の、atom.xmlテンプレートをそのまま利用していると、2007年に入ってから再構築したときに内容が変わってしまい、Atomフィードを購読している読者の側で、未読ではない記事が未読として表示されてしまうなどの軽微な問題が起こる可能性がある」とのことでスクリプトの修正を勧めています。
まあ、それほど重大な問題ではないようですが年も押し迫ってきたことですし(笑)一応対応しました。
■Atom(デフォルト・テンプレート)変更箇所
<id>tag:<$MTBlogHost exclude_port="1" encode_xml="1"$>,<$MTDate format="%Y"$>:<$MTBlogRelativeURL encode_xml="1"$>/<$MTBlogID$></id>
■変更後
<id>tag:<$MTBlogHost exclude_port="1" encode_xml="1"$>,2006:<$MTBlogRelativeURL encode_xml="1"$>/<$MTBlogID$></id>